Приняв в 1914 году решение о строительстве железной дороги «Казань – Екатеринбург», правление Общества Московско-Казанской дороги заказало проектирование станционных сооружений академику А. В. Щусеву, лучшему архитектору, автору великолепного здания Казанского вокзала в Москве, мавзолея Ленина, гостиницы Москва. В 1914‒1916 годах он разработал недорогие типовые проекты вокзалов разных классов, а также других построек – жилых домов, школ, амбулаторий. По этим проектам и были построены вокзалы и привокзальные сооружения по всему казанскому направлению.

Среди леса, на топком заболоченном месте был построен деревянный вокзал, на нем появилась надпись «Кизнеръ». Станцию назвали по находящемуся неподалеку селу – Кизнер. В начале 1916 года на железной дороге завершается строительство станции, и начинается движение поездов.

Железнодорожный вокзал является уникальным памятником деревянного зодчества, объектом культурного наследия.